思路迪诊断：多中心队列研究再证DNA+RNA共检可提升NSCLC患者融合检出率

2023年，非小细胞肺癌（NSCLC）NCCN指南中推荐RNA-based NGS作为融合变异的检测方式，同时建议在DNA-based NGS检测驱动基因阴性后作为补充检测手段，在这之后，RNA检测受到了广泛的关注。2024年11月，《JAMA Network Open》上发表了一项多中心、回顾性队列研究，该研究为DNA-based NGS联合RNA-based NGS（DNA+RNA共检）在检测融合和剪切变异上的优势带来了新的证据。

RNA检测融合研究现状

对于基因融合及剪切变异（aSVs）的检测，DNA在结构上往往由于冗长的内含子结构而出现错检漏检的情况，在临床实际中也证实DNA在检测aSVs上不及RNA有优势。

多项临床研究显示，相较于DNA-based NGS，RNA-based NGS能够多检出8.3%~14.2%的aSVs，通过RNA-based NGS检测，MET剪切变异引起的14号外显子跳跃突变（MET 14跳突）可提升至2.42%。此外，在既往研究中显示，在DNA检测阴性但RNA检测到融合阳性的患者中，约70%~80%患者对靶向治疗响应，可见RNA-based NGS检测到的aSVs与靶向治疗的疗效也更具有相关性。

DNA+RNA共检提升晚期NSCLC患者aSVs检出率

2024年11月，一项多中心、回顾性队列研究将5570名晚期晚期（IIIb-IV期）肺腺癌患者纳入了Tempus多模态数据库中，这些患者具有足够的组织样本用于RNA-based NGS和DNA-based NGS检测。研究结果显示，与单独使用DNA-based NGS相比，同时进行RNA-based NGS和DNA-based NGS检测到携带aSVs的患者增加了15.3%，这为DNA+RNA共检的必要性提供了新的证据。

主要研究结果显示，8.8%（491/5,570）的患者中发现了至少一个符合NCCN推荐靶向治疗的aSVs。在检测到aSVs的491例患者中，104例在检测时未接受过靶向治疗，其中84例（80.8%）在检测后接受了NCCN推荐的匹配靶向治疗，未接受匹配治疗的患者（n=20）接受了联合化疗和免疫治疗。分析结果显示，用于aSVs的检测方法与采用相应靶向治疗或临床结果之间没有明显关联。同时通过RNA-based NGS和DNA-based NGS检测并接受靶向治疗的aSVs患者的TTNT（多中心无进展生存的替代终点）无明显差异（19.7个月 vs 14.9个月）。

此外，对目前NSCLC指南尚无用药推荐的BRAF、NRG1、EGFR和FGFR2/3融合定义为新兴结构变异（eSVs）并进行分析。结果显示，eSVs总体发生率为0.7%（40/5,570）。其中53%（21/40）的eSVs仅通过RNA-based NGS检测到。与仅使用DNA-based NGS相比，增加RNA-NGS检测后eSVs检出率增加了一倍多。

由此可见，RNA在检测基因融合及剪切变异上具备较大优势，能提升其检出率，这种优势不仅限于指南推荐的可用药融合靶点，对未来有靶向治疗潜力的基因同样适用。RNA是融合及剪切变异检测的最优选，而DNA在点突变/插入缺失（SNV/indel）等变异形式的检测具有优势，对于NSCLC这类靶点丰富的癌种，DNA+RNA共检是未来的必然选择。

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