出生后使用抗生素对婴儿肠道微生物群和耐药性有重要影响

人类肠道菌群对健康和疾病的重要性十分重要。婴儿在出生后肠道微生物群落组成的紊乱会造成其早期和以后生活中出现的一系列健康问题，如婴儿绞痛、气喘、过敏、功能性胃肠紊乱、肥胖和一般的免疫发育改变。而剖宫产(CS)分娩、配方奶喂养(相对于母乳喂养)和抗生素对新生儿肠道微生物群发育都会有影响。特别是抗生素治疗，长期改变了儿童和成人肠道菌群的物种多样性(α-多样性)和群落组成。在新生儿出生后的头几周内，在肠道微生物群的早期组装阶段使用抗生素，其微生态副作用可能更加明显和持久。然而，在出生第一周内，多达10%的新生儿会被开广谱抗生素用以治疗早发新生儿败血症(sEONS)。  

近日，在Nat Commun上发表的一篇题为"Effects of early-life antibiotics on the developing infant gut microbiome and resistome： a randomized trial"的研究性论文以出生一周内就接受抗生素治疗的新生儿为研究对象，分析了他们在肠道微生态和抗菌素耐药性基因的变化。该研究有助于找出对微生态和抗菌素耐药基因影响最小的抗生素方案。

  在本研究中，有147名在≥36周出生的婴儿在出生后第一周就需要使用广谱抗生素治疗sEONS，并随机接受了三种常用的静脉抗生素组合，即青霉素+庆大霉素、co-克拉维酸+庆大霉素或阿莫西林+头孢噻肟（ZEBRA研究，试验注册NL4882)），平均抗生素治疗时间为48小时。健康出生组的80名非抗生素治疗婴儿作为对照组(MUIS研究，试验注册NL3821)。在治疗前和治疗后、1、4和12个月龄收集直肠拭子和/或粪便样本。通过16S rRNA测序对样本菌群进行了表征分析，利用靶向qPCR检测了31个抗菌耐药基因，并在样本的一个子集上进行了宏基因组测序用以验证。  

结果表明，整个肠道微生物群落组成和抗菌素耐药性基因在进行直接治疗后发生转变(R2 = 9.5%，调整后的假定值= 0.001和R2 = 7.5%，调整假定值= 0.001，分别)，和在12月龄时恢复常规化(R2 = 1.1%，调整后的假定值= 0.03和R2 = 0.6%，调整假定值= 0.23，分别)。研究发现，与对照组相比，服用抗生素的婴儿中双歧杆菌的丰度减少，克雷伯氏菌和肠球菌的丰度增加。阿莫西林+头孢噻肟对婴儿肠道微生物群落组成和耐药基因谱的影响最大，而青霉素+庆大霉素的影响最小。  

图 婴儿肠道微生物的平均相对丰度  

这些数据表明，凭借经验使用抗生素会造成不良的肠道微生态副作用（生物谷Bioon.com）。  

参考文献：

Reyman， M.， van Houten， M.A.， Watson， R.L. et al. Effects of early-life antibiotics on the developing infant gut microbiome and resistome： a randomized trial. Nat Commun 13， 893 (2022). https：//doi.org/10.1038/s41467-022-28525-z